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高阶科研 | 环境微生物学中的生物信息学:碳对微生态系的影响

发布时间:2025年09月12日 12:21

重大项目背景

运用来自广为栖息地的16S核糖体RNA(rRNA)基因或宏蛋白质组学深入调查,研究者发现了境遇在我们生命体上的病原体的惊人自然。但是,同一时间只有一小部分(

病原体的顺利培育出关键取决于适当的生长培育出基和孵育状况的选择。在这里,我们应用了简单的有机碳源和复杂的天然有机碳源来从淡水河里培育出病原体群落。我们的结果表明,复杂的碳源比简单的碳源在氟化物多种病原体之外要有效得多。富含复杂碳的透观世界显示出有机体自然(最主要门)明显更高的有机体自然,而这些在官方的中华文化收藏里所分之二比例较低。随后从复杂的碳氟化物里分开出来,产生了200多种病原体分开株,最主要候选的新型,很少培育出的和未有叙述的有机体。这项深入研究的结果将大大倡导培育出和分开方针,以从自然环境里回收各种新颖的病原体。荣获得“一次未能培育出的”病原体的树胶代表物将增强我们对海中生态系统不尽相同有机体地球物理化学生态位里病原体生理学和功能的理解。

原则上信息

● 他的学生1对1

● 远程线上

● 重大项目足足2-5个月初

适合人群

● 本科生、深入研究生

● 对自然材料科学、有机体信息学、病原体学感兴趣的学姐

● 希望接触海外顶尖工程技术他的团队和研究员一起好好深入研究,趣味多国工程技术自然环境的学生

他的学生背景

X. Wu 他的学生

美国加州大学伯克利分校教职员,劳伦斯伯克利国家实验室研究者。北京大学自然环境有机体学麻省理工学院,里山大学物理化学有机体学硕士,里山大学物理化学学士。深入研究领域为自然环境废水物理化学,自然环境毒理学,和自然环境病原体。在美兼职期间以重大项目副局长或主要深入研究部门身份参与多项美国农业部,瑞典政府,参谋总长支助的深入研究重大项目。在国外的深入学术论文曾荣获里国国家自然科学奖二等奖。

学习内容

1. 背景基本知识

2. 全面性

3. PCR创刊号氢化核心技术和PCR核心技术

4. 扩增子读段的妥善处理

5. 病原体群落比对

a. 耕作状况对社区一组的阻碍

b. 不具备不尽相同碳源的培育出物里的病原体自然

c. 非常丰富的新型病原体种类的统计选择

d. 数据仿真

6. 分开病原体菌株的归类学归类

深入研究亮点

1.适用PCRPCR核心技术的基于扩增子的病原体比对和方法。

2.比对病原体群落结构(适用R)

3.抽样(适用R)

4.数据仿真

主要工具/深入研究方法

抽样、数据仿真、DNAPCR核心技术、病原体比对方法

先导授课

史料阅读和学术著作的写作方法、R编程、有机体抽样的原则上方法

重大项目收荣获

● 一段沉浸式的工程技术境况

● 他的学生全方位读后(10所网推)

● EI/CPCI亚太地区内阁会议学术著作(法理一作)

● 其他级别学术著作可定制(法理一作)

● 重大项目结业证书

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